“孟德尔豌豆杂交实验（二）中对自由组合现象的解释”是高中生物遗传部分教学的第一个难点。依据1：学生弄不清自由组合定律与分离定律的关系。虽然刚刚学完一对相对性状的分离定律，但如何引导学生找到9：3：3：1与3：1之间的关系即“两对相对性状与一对相对性状之间的关系”是教学的一个难点。不仅从性状表型比例，以及后面的配子比例，遗传因子的比例都是如此。依据2：学生对F1为什么会产生4种配子，产生哪四种配子且比例为1：1：1：1不理解。依据3：本部分内容涉及到遗传性状与遗传因之间的对应关系。F1雌雄配子各产生4种配子，雌雄配子随机结合形成的16种组合方式，为什么形成了9种遗传因子组成？这9种遗传因子组成又如何分别对应四种表型，且每一种遗传因子组成所对应的比例是多少？这都是很多学生的困惑点。如何从遗传因子组成角度去理解9：3：3：1的含义，如何引导学生不依赖棋盘根据分离定律直接得出结论，是教学的难点。而且如何设计实验探究各表型对应哪一种遗传因子组成，也是考查学生科学探究能力的一个难点。依据4：如何理解自由组合定律的实质，涉及到减数分裂与受精作用的内容。依据5：如何理解决定不同性状的遗传因子独立遗传涉及到染色体与基因的位置关系，也是学习伴性遗传的基础。所以本节课涉及到遗传的分子基础，又涉及到遗传的细胞学基础，涉及到性状表型与遗传因子的对应关系，涉及应用数学方法进行概率计算与推导，总之需要学生有较强的数学思维，科学思维，演绎推理和科学探究能力。
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